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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Suínos e Aves. |
Data corrente: |
11/05/2017 |
Data da última atualização: |
09/05/2018 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
PERTILLE, F.; MOREIRA, G. C. M. M.; ZANELLA, R.; NUNES, J. de R. da S.; BOSCHIERO, C.; ROVADOSCKI, G. A.; MOURÃO, G. B.; LEDUR, M. C.; COUTINHO, L. L. |
Afiliação: |
FÁBIO PÉRTILLE, ESALQ; GABRIEL COSTA MONTEIRO MOREIRA, ESALQ; RICARDO ZANELLA, UPF; JOSÉ DE RIBAMAR DA SILVA NUNES, ESALQ; CLARISSA BOSCHIERO, ESALQ; GREGORI ALBERTO ROVADOSCKI, ESALQ; GERSON BARRETO MOURÃO, ESALQ; MONICA CORREA LEDUR, CNPSA; LUIZ LEHMANN COUTINHO, ESALQ. |
Título: |
Genome-wide association study for performance traits in chickens using genotype by sequencing approach. |
Ano de publicação: |
2017 |
Fonte/Imprenta: |
Scientific Reports, v. 7, n. 41748, 2017. |
DOI: |
10.1038/srep41748 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
Performance traits are economically important and are targets for selection in breeding programs, especially in the poultry industry. To identify regions on the chicken genome associated with performance traits, different genomic approaches have been applied in the last years. The aim of this study was the application of CornellGBS approach (134,528 SNPs generated from a PstI restriction enzyme) on Genome-Wide Association Studies (GWAS) in an outbred F2 chicken population. We have validated 91.7% of these 134,528 SNPs after imputation of missed genotypes. Out of those, 20 SNPs were associated with feed conversion, one was associated with body weight at 35 days of age (P < 7.86E-07) and 93 were suggestively associated with a variety of performance traits (P < 1.57E-05). The majority of these SNPs (86.2%) overlapped with previously mapped QTL for the same performance traits and some of the SNPs also showed novel potential QTL regions. The results obtained in this study suggests future searches for candidate genes and QTL refinements as well as potential use of the SNPs described here in breeding programs. |
Palavras-Chave: |
Ave. |
Thesagro: |
Galinha; Genoma; Melhoramento genético animal. |
Thesaurus Nal: |
Animal breeding; Chickens; Genome. |
Categoria do assunto: |
-- |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/159737/1/final8329.pdf
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Marc: |
LEADER 02005naa a2200313 a 4500 001 2069532 005 2018-05-09 008 2017 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $a10.1038/srep41748$2DOI 100 1 $aPERTILLE, F. 245 $aGenome-wide association study for performance traits in chickens using genotype by sequencing approach.$h[electronic resource] 260 $c2017 520 $aPerformance traits are economically important and are targets for selection in breeding programs, especially in the poultry industry. To identify regions on the chicken genome associated with performance traits, different genomic approaches have been applied in the last years. The aim of this study was the application of CornellGBS approach (134,528 SNPs generated from a PstI restriction enzyme) on Genome-Wide Association Studies (GWAS) in an outbred F2 chicken population. We have validated 91.7% of these 134,528 SNPs after imputation of missed genotypes. Out of those, 20 SNPs were associated with feed conversion, one was associated with body weight at 35 days of age (P < 7.86E-07) and 93 were suggestively associated with a variety of performance traits (P < 1.57E-05). The majority of these SNPs (86.2%) overlapped with previously mapped QTL for the same performance traits and some of the SNPs also showed novel potential QTL regions. The results obtained in this study suggests future searches for candidate genes and QTL refinements as well as potential use of the SNPs described here in breeding programs. 650 $aAnimal breeding 650 $aChickens 650 $aGenome 650 $aGalinha 650 $aGenoma 650 $aMelhoramento genético animal 653 $aAve 700 1 $aMOREIRA, G. C. M. M. 700 1 $aZANELLA, R. 700 1 $aNUNES, J. de R. da S. 700 1 $aBOSCHIERO, C. 700 1 $aROVADOSCKI, G. A. 700 1 $aMOURÃO, G. B. 700 1 $aLEDUR, M. C. 700 1 $aCOUTINHO, L. L. 773 $tScientific Reports$gv. 7, n. 41748, 2017.
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Registro original: |
Embrapa Suínos e Aves (CNPSA) |
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Registros recuperados : 16 | |
3. | | PÉRTILLE, F.; ZANELLA, R.; FELÍCIO, A. M.; LEDUR, M. C.; PEIXOTO, J. de O.; COUTINHO, L. L. Identification of polymorphisms associated with production traits on chicken (Gallus gallus) chromosome 4. Genetics and Molecular Research, v. 14, n. 3, p. 10717-10728, 2015.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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4. | | MOREIRA, G. C. M.; PÉRTILLE, F.; GODOY, T. F.; BRASSOLOTI, R.; BOSCHIERO, C.; LEDUR, M. C.; COUTINHO, L. L. Discovery of candidate genes for fatness in chickens based on genotyping with 600K SNP chip in a QTL region. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 60., 2014, Guarujá. Resumos? Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2014. p. 64Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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5. | | PÉRTILLE, F.; IBELLI, A. M. G.; SHARIF, M. E.; POLETI, M. D.; FRÖHLICH, A. S.; REZAEI, S.; LEDUR, M. C.; JENSEN, P.; GUERRERO-BOSAGNA, C.; COUTINHO. L. L. Putative epigenetic biomarkers of stress in red blood cells of chickens reared across different biomes. Frontiers in Genetics, 20 Nov 2020.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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6. | | PÉRTILLE, F.; FELÍCIO, A. M.; ROSÁRIO, M. F. do; SILVA, V. H.; MANGUETTI, T.; SILVA, N. A.; LEDUR, M. C.; COUTINHO, L. L. PPARGC1A indel polymorphism is associated with performance and carcass traits in chickens. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 58., 2012, Foz do Iguaçu. Resumos... Foz do Iguaçú: SBG, 2012. p. 72Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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7. | | PÉRTILLE, F.; BOSAGNA, C. G.; SILVA, V. H. da; BOSCHIERO, C.; NUNES, J. de R. da S.; LEDUR, M. C.; JENSEN, P.; COUTINHO, L. L. High-throughput and cost-effective chicken genotyping using next-generation sequencing. Scientific Reports, v. 6, n. 26929, 2016.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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8. | | PÉRTILLE, F.; TESSMANN, A. L.; COUTINHO, L. L.; AVILA, V. S. de; PEIXOTO, J. de O.; COLDEBELLA, A.; LEDUR, M. C. Investigation of the LEPR1 A>G polymorphism in the leptin receptor gene in a commercial broiler population. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 57., 2011, Águas de Lindóia. Resumos. Águas de Lindóia: SBG, 2011. p.103. Projeto/Plano de Ação: 01.06.10602-03.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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9. | | SILVA, V. H. da; REGITANO, L. C. de A.; GEISTLINGER, L.; PÉRTILLE, F.; GIACHETTO, P. F.; BRASSALOTI, R. A.; MOROSINI, N. S.; ZIMMER, R.; COUTINHO, L. L. Genome-wide detection of CNVs and their association with meat tenderness in Nelore cattle. Plos One, june 2016.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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10. | | POLETI, M. D.; REGITANO, L. C. de A.; SOUZA, G. H. M. F.; CESAR, A. S. M.; SIMAS, R. C.; VIGNATTO, B. S.; MONTENEGRO, H.; PÉRTILLE, F.; BALIEIRO, J. C. C.; CAMERON, L. C.; ELER, J. P.; COUTINHO, L. L. Proteome alterations associated with the oleic acid and cis-9, trans-11 conjugated linoleic acid content in bovine skeletal muscle. Journal of Proteomics, v. 222, p. 1-14, e103792, jun. 2020.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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11. | | DAL PIZZOL, M. S.; IBELLI, A. M. G.; MORÉS, N.; MORES, M. A. Z.; PEIXOTO, J. de O.; SAVOLDI, I. R.; PERTILLE, F.; MARIANI, P. D. S. C.; COUTINHO, L. L.; LEDUR, M. C. Perfil de metilação diferencial no cromossomo 6 de suínos normais e afetados com osteocondrose latens. In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 13., 2019, Concórdia. Anais... Concórdia: Embrapa Suínos e Aves: UNC, 2019. p. 36-37. JINC 2019.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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12. | | DAL PIZZOL, M. S.; IBELLI, A. M. G.; SALMÓRIA, L. A.; MORES, M. A. Z.; PEIXOTO, J. de O.; SAVOLDI, I. R.; PERTILLE, F.; MARIANI, P. D. S. C.; COUTINHO, L. L.; LEDUR, M. C. Perfil de metilação diferencial em suínos normais e afetados com osteocondrose latens. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL ON-LINE, 14., 2021. Anais... Chapecó: UDESC: Concórdia: Embrapa Suínos e Aves, 2022.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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13. | | MOREIRA, G. C. M.; BOSCHIERO, C.; CESAR, A. S. M.; REECY, J. M.; GODOY, T. F.; PÉRTILLE, F.; LEDUR, M. C.; MOURA, A. S. A. M. T. M.; GARRICK, D. J.; COUTINHO, L. L. Integration of genome wide association studies and whole genome sequencing provides novel insights into fat deposition in chicken. Scientific Reports, v. 8, n. 16222, 2018.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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14. | | ZANELLA, R.; LAGO, L. V.; SILVA, A. N. da; PÉRTILLE, F.; CARVALHO, N. S. de; PANETTO, J. C. do C.; ZANELLA, G. C.; FACIOLI, F. L.; SILVA, M. V. G. B. Genetic characterization of Indubrasil cattle breed population. Veterinary Sciences, v. 5, n. 4, 2018. 10 p.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 5 |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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15. | | PERTILLE, F.; MOREIRA, G. C. M. M.; ZANELLA, R.; NUNES, J. de R. da S.; BOSCHIERO, C.; ROVADOSCKI, G. A.; MOURÃO, G. B.; LEDUR, M. C.; COUTINHO, L. L. Genome-wide association study for performance traits in chickens using genotype by sequencing approach. Scientific Reports, v. 7, n. 41748, 2017.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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16. | | MOREIRA, G. C. M.; POLETI, M. D.; PÉRTILLE, F.; BOSCHIERO, C.; CESAR, A. S. M.; GODOY, T. F.; LEDUR, M. C.; REECY, J. M.; GARRICK, D. J.; COUTINHO, L. L. Unraveling genomic associations with feed efficiency and body weight traits in chickens through an integrative approach. BMC Genetics, v. 20, n. 83, 2019.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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